La gouvernance du Collège GLAREAN se compose de trois organes aux missions bien définies :
- un comité de direction
- un conseil
- l'assemblée générale des membres :
directeurs scientifiques de l'Université de Strasbourg ;
directeurs scientifiques de la Hochschule für Musik Freiburg
directeurs artistiques de la HEAR de Strasbourg ;
directeurs artistiques de la Hochschule für Musik Freiburg ;
doctorants rattachés au Collège GLAREAN.